Аудио и видео. Ну тут вообще простор для действий. Как под форточки так и под пингвина есть огромное количество софта. В основном эти программы используют системные кодеки и отличаются только интерфейсом и количеством абсолютно бесполезных функций. А-ля китайские бумбоксы из 90х. Но стоит отметить один продукт - VLC. Плеер минималистичного дизайна с огромным внутренним потенциалом. Советую попробовать.
Противопоказания - у Вас еже есть свой любимый плеер:)

Про всевозможные интернет клиенты вообще молчу. Про другие браузеры и так все знают. менеджеров всяких тоже навалом, альтернативных почтовых клиентов. Единственное, нет и не будет альтернативы клиенту скайп. Тут мерзасофт подсуетился. Чтож, ждем очередную прорывную, свободную альтернативу данной технологии.

Ладно, перечислять можно до бесконечности. Резюме - почти для каждой программы существует свободный или бесплатный аналог. Надо только немного поискать. На данный момент у меня только один пакет не имеет свободной альтернативы - компилятор и отладчик под специализированные микроконтроллеры. Под него держу хрюшу в виртуалке.
И еще один плюс - даже если Intel и AMD перестанут нам продавать процессоры, все вышеперечисленное добро прекрасно будет работать под свободным Линуксом хоть на ARM, хоть на MIPS, а тем более на Эльбрусах:) И уже во всю работает!!!