В начале декабря 2004 г. Т. Джейкоб извлек большинство останков из хранилища в национальном исследовательском центре археологии в Джакарте с разрешения только одного из руководителей проекта, и скрывал их в течение 3 месяцев. Некоторые ученые выражали обеспокоенность по поводу того, что важные научные свидетельства будут присвоены небольшой группой исследователей, которые не будут ни допускать к ним других ученых, ни публиковать результаты собственных исследований. Джейкоб возвратил останки 23 февраля 2005 г., однако к ужасу своих коллег, часть из них была серьезно повреждена, а 2 кости ног вообще отсутствовали.
Джейкоб отрицал свою вину, утверждая, что повреждения были причинены во время транспортировки из Джокьякарты в Джакарту. Однако по отчетам других ученых характер повреждений совершенно иной — физические свидетельства говорят о разрушении образцов во время изготовления отливок. Например, одна из челюстей была сломана, а затем склеена, причем части были собраны под неправильным углом.
В 2005 г. индонезийские власти закрыли доступ в пещеру. Некоторые СМИ (например, BBC) распространили мнение, что причиной этого запрета стала попытка защитить Джейкоба, который был провозглашен «индонезийским королем палеоантропологии», от доказательств его неправоты. Доступ в пещеру вновь был разрешен в 2007 г., вскоре после смерти Джейкоба.

Are Homo Floresiensis Living in the Jungles of South East Asia ?

Уже в 2013 году американские ученые, создавшие модель тела Homo floresiensis, опровергли гипотезу о том, что останки человека флоресского соответствуют останкам современного человека, страдавшего микроцефалией.
Ученые из Медицинского центра Университета Стони Брук (США) создали модель тела Homo floresiensis и убедились в том, что человека флоресского действительно необходимо выделять в новый вид. Останки H. floresiensis были обнаружены в пещере Лианг-Буа на индонезийском острове Флорес (см. карту) в 2003 году. Некоторые специалисты утверждают, что эта находка не слишком важна; по их мнению, миниатюрный скелет человека флоресского вполне соответствует скелету современного человека с признаками микроцефалии — дефекта развития, связанного с уменьшением размеров черепа и головного мозга. Авторы работы изучили прекрасно сохранившиеся останки женщины (LB1), которую называют «флоресской леди».
В распоряжении исследователей оказались череп, челюсть, кости рук, кистей, ног и ступней LB1. Объем черепной коробки LB1 составляет всего около 400 см куб., что приблизительно соответствует мозгу современного шимпанзе. Проведя статистический анализ особенностей строения черепов различных гоминидов, ученые пришли к выводу о том, что современных людей можно объединить в одну группу, микроцефалов — в другую, а человек флоресский и вымершие представители трибы гоминини образуют третью, отдельную группу. На следующем этапе работы исследователи создали модель тела H. floresiensis. Расчетный рост LB1 составил около 106 см, что мало похоже на современных пигмеев Центральной и Южной Африки, Андаманских островов и Филиппин, достигающих 150 см. Не совпадают и значения индекса массы тела; кроме того, чрезвычайно малую длину имеют бедренная и большеберцовая кости человека флоресского. Небольшая часть антропологов продолжает настаивать на том, что эти черты строения H. floresiensis служат примером «обратного» эволюционного развития и так называемой островной карликовости.
«Мне сложно поверить в то, что результатом эволюционных изменений мог стать менее экономичный способ передвижения, — отвечает оппонентам участник исследования Уильям Джангерс (William Jungers).
— Как известно, животному, которое перемещается на двух конечностях, выгодно иметь длинные ноги. Мы считаем, что короткие кости человека флоресского — это примитивные черты, сохранившиеся с давних времен». Полная версия отчета ученых опубликована в журнале Significance.

NOVA scienceNOW : 6 - Little people of flores