В условиях изменившейся политической ситуации для сохранения деловых связей в области профессиональных интересов, для координации и объединения усилий в решении своих насущных проблем по инициативе директоров ведущих зоопарков России, стран СНГ и Балтии в 1994 году на базе Московского зоопарка была создана Евроазиатская Региональная Ассоциация Зоопарков и Аквариумов (ЕАРАЗА). Она является некоммерческой общественной организацией, объединяет на добровольной основе зоопарки, аквариумы и другие аналогичные организации, поддерживающие деятельность зоопарков и аквариумов, и не ставит своей целью извлечение прибыли.
С самого начала при создании зоопарка одной из важнейших его задач была организация образовательной и просветительной работы среди посетителей. В наши дни эта деятельность не только сохранилась, но и стала более разнообразной.

В зоопарке проводятся разнообразные групповые экскурсии и беседы, во время которых посетителей знакомят с многообразием животного мира, биологией отдельных видов, проблемами экологии и охраны природы. Лекционную работу зоопарк ведет не только на своей территории, но и в школах, клубах, дворцах и парках культуры, в летних лагерях, в детских домах и интернатах, в библиотеках, санаториях и других учреждениях Москвы и Подмосковья. Лекции сопровождаются показом прирученных животных и неизменно вызывают большой интерес у слушателей, независимо от возраста и уровня подготовки.

С 1924 года и по настоящее время работает Кружок Юных Биологов Зоопарка. Много лет среди юных натуралистов проводится конкурс научных работ имени П.А. Мантейфеля, в котором принимают участие дети со всей страны. С детьми младшего школьного возраста занимаются в кружке «Манулята».
В зоопарке есть Детский театр «Тик-так». С октября по май спектакли проходят в помещении театра, а в течение всего лета, по пятницам, субботам и воскресеньям, артисты выступают на летней открытой эстраде Детского зоопарка, где зрителями и участниками представления становятся все желающие. При театре существует детская театральная студия.
В течение всего года в зоопарке проходят различные праздники — Новый год, «День Рождения зоопарка», «День тигра», «День Птиц», «День Земли». Мы стараемся сделать каждый праздник оригинальным и запоминающимся. В них принимают участие клоуны, коллективы ростовых кукол, фольклорные группы. И, конечно же, многие маленькие зрители уносят с собой сувениры и призы от Московского зоопарка.

Ежегодно проходят два театральных фестиваля: весной «Экология. Творчество. Дети» и в течение всего лета «Животные – герои сказок», участниками которых становятся творческие коллективы со всех концов страны.
В Выставочном зале Главного входа проходят различные выставки, иногда с участием живых экспонатов.
Сейчас в Московском зоопарке содержится более восьми тысяч животных, относящихся к более чем тысяче видов мировой фауны. Некоторые виды разведены специалистами зоопарка впервые в мире. Зоопарк является членом Всемирной и Европейской ассоциации зоопарков и аквариумов (WAZA, EAZA), Евроазиатской региональной ассоциации зоопарков и аквариумов (ЕАРАЗА). Участвует во многих международных программах по сохранению исчезающих видов животных, сотрудничая с природоохранными организациями всего мира.